Pinguinul de Galapagos este singura specie de pinguin care poate fi găsită la nord de Ecuator (în Ecuador) şi în Insulele Galápagos. Fiind ameninţată în special de poluare, capturi accidentale şi schimbări climatice, această specie este clasificată în pericol de dispariţie de organizaţia World Wide Fund for Nature (WWF).
Monitorizarea pe termen lung indică faptul că această specie suferă fluctuaţii severe, în primul rând ca urmare a perturbaţiilor marine care pot deveni mai extreme. Aceste perturbaţii au generat o reducere globală foarte rapidă a populaţiei de pinguini în ultimele trei generaţii (34 de ani). În plus, are o populaţie mică (mai puţin de 2000 de exemplare) şi este limitată la un habitat restrâns, aproape toate păsările crescând într-o singură locaţie.
Ultimele evenimente puternice El Nino au cauzat mortalităţi de până la 77%, din cauza reducerii ratei de înmulţire şi a declinului dramatic al speciilor ce reprezintă prada pinguinilor. Alţi factori care reprezintă o ameninţare pentru pinguinii de Galapagos sunt speciile introduse, cum ar fi câinii, care poartă boli ce se pot răspândi şi la pinguini, în timp ce pisicile reprezintă o ameninţare ca prădători. Toţi aceşti factori califică specia ca fiind pe cale de dispariţie.
